呼吸机相关肺炎的诊断更为困难。一般的临床指征是发热、脓性气管吸出物及新的胸部浸润阴影。其敏感性<50%.。无菌取下呼吸道分泌物并做定量细菌培养的方法，不比床旁判断有效，而且是侵袭性的，费用高，不能广泛使用，此法亦不能改善病人总的后果。
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