强直性脊柱炎早期可有乏力、低热、食欲减退、体重下降等全身症状。除中轴关节(脊柱)受累外，还有其它系统受累。
眼睛是最易侵犯的器官之一，约2％的病人出现眼部的改变，表现为虹膜炎或葡萄膜炎，甚至先于脊柱症状之前出现：，眼病多为急性发病，常为单侧、也可双侧受累，且与强直性脊柱炎的轻重无关，一般为自限性，但易复发。—般需局部或全身糖皮质激素治疗。HLA—B27阳性的病人发生眼病的可能性更大。
强直性脊柱炎也可影响心血管系统，包括下行性主动脉瓣膜下纤维化、上动脉瓣关闭不全、二尖瓣脱垂及：二尖瓣关闭不全、心脏扩大和心脏传导障碍等。心脏听诊可有杂音，心脏病变的发生率随病程及年龄而增加；
强直性脊柱炎累及肺的主要表现为肺上叶纤维化、肺大疱，有的表现为斑片状或索条状阴影，甚至有空洞形成。
强直性脊柱炎可有肾淀粉样病变，出现尿蛋白等。强直性脊柱炎如影响到神经系统，则可表现为马尾综合征，即脊髓的尾部受累表现的症状：小腿和臀部疼痛，肠道和膀胱症状以及神经功能丧失，脊髓造影发现有憩室。马尾综合征是罕见的合并症。
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