由于某些药品广告的误导，加之不了解吗叮啉的药理作用、配伍禁忌等情况，许多患者滥用吗叮啉，甚至把它作为治疗药长期服用，或与其它药物合用，这不但没有使疾病康复，反而加重病情。
比如，硫糖铝是一种抗消化酶药物，具有局部抗溃疡作用，可在溃疡创面上形成保护膜，覆盖于溃疡面，阻止胃酸、胃蛋白酶和胆汁酸的渗透与侵袭，有利于粘膜的再生和溃疡的愈合。而吗叮啉是外周性多巴胺受体拮抗剂，可促进胃肠道的蠕动，使胃肠道张力恢复正常，促进胃排空。两药合用后，因吗丁啉的胃动力作用，缩短了硫糖铝在胃中停留时间，使其疗效减弱。因此，服用时需间隔1小时以上，不但可以增强疗效，还可减轻恶心、呕吐症状。
另外，吗丁啉也不应与抑制胃酸分泌类药(雷尼替丁、甲氰咪呱、洛赛克等)合用，因彼此合用减少了该药在胃中停留的时间，抗胃酸分泌作用就会减弱，从而影响治疗溃疡病的效果。吗丁啉药是促进胃肠蠕动，而抗胆碱药(颠茄片、阿托品、普鲁本辛等)属抑制胃肠蠕动药，二者作用正好相反，所以胃肠疾病引起的腹部疼痛，如服用止痛剂时切忌同服吗丁啉。
虽然吗丁啉属于非处方药，但在使用过程中作为患者还是应该认真阅读说明书后，根据说胆书正确进行服用，切不可拿来就吃。
